Генетические маркеры в селекции свиней

EST-маркеры являются одной из разновидностей STSs и представляют собой маркеры к экспрессирующимся последовательностям генома (генам). Основным источником информации для создания EST-маркеров является использование нуклеотидных последовательностей комплементарных ДНК, получаемых с помощью обратной транскриптазы на основе мРНК, изолированных из разных тканей и представляющих экспрессирующиеся в этих тканях гены (кДНК). ESTs используются для построения транскрипционных карт геномов, выявления тестируемых генов, поиска новых генов.

4.     Заключение

Первыми молекулярными маркерами были маркеры на основе белкового полиморфизма (биохимический полиморфизм, аллозимы). Они оставались единственными молекулярными маркерами вплоть до 1980 г., когда были предложены маркеры, основанные на полиморфизме генетического материала, полиморфизме ДНК. До 1988 г. разнообразие ДНК-маркеров было невелико (ПДРФ и минисателлиты). Но с изобретением ПЦР ситуация изменилась и на сегодняшний день научное сообщество располагает большим количеством самых разнообразных ДНК-маркеров, различающихся по своим свойствам и информативности.

Развитие науки идет по пути применения высоких технологий, позволяющих одновременно анализировать большой массив образцов путем автоматизации скрининга. Для анализа малоизученных геномов, по-видимому, будут использоваться два подхода: AFLP и ISSR. Сохранят свое значение при решении конкретных задач методы анализа белкового полиморфизма и рестрикционного полиморфизма ДНК с помощью ПЦР-ПДРФ.

В ближайшее десятилетие, скорее всего, использование анализа микросателлитов, как одного из наиболее информативных маркеров будет сокращаться из-за трудностей автоматизации скрининга их аллельных вариантов. Информативность же микросателлитов может быть компенсирована одновременным автоматизированным скринингом на одном образце десятков, сотен и даже тысяч биаллельных SNPs. Этот тип маркеров, по-видимому, будет активно использоваться в ближайшие годы и даже десятилетия. Уже к настоящему времени разработаны высокотехнологичные способы их тестирования: микропанели, использование капиллярных методов разделения ПЦР-продуктов, новых физических методов анализа. Основным ограничением методов массового скрининга SNPs - это высокая стоимость оборудования и реагентов. Конкуренцию SNPs может составить только секвенирование ДНК, несомненно являющееся самым точным и информативным методом анализа полиморфизма ДНК. Ограничением его служит только высокая стоимость анализа. При разработке более совершенных и дешёвых технологий этот подход может стать преобладающим.

Таким образом, на наших глазах происходит смена методологии научных исследований: они все более переходят от "штучного" анализа к автоматизированному массовому скринингу образцов ДНК с использованием высоких технологий.

Библиографический список

1.      Зиновьева Н. Методы селекции / Н.Зиновьева, Е.Гладырь // Животноводство России. – 2006. – №3. – с. 29-31.

2.      Марзанов Н. Генетические маркеры в селекции свиней / Н.Марзанов, А.Филатов // Племенное дело и генетика. – 2007. – №5. – с. 2-4.

3.      Кунаева Е.К. Влияние ДНК-маркеров на плодовитость свиноматок / Е.К.Кунаева, Л.Н.Стюнина // Свиноводство. Промышленное и племенное. – 2005. – №5. – с. 18-22.

4.      Черкаева Е.А. Селекционно-генетические маркеры в свиноводстве / Е.А.Черкаева // Вестник РАСХН. – 2006. – №5. – с. 29-31.

5.      http://lab-cga.ru – ДНК-маркеры в генетических исследованиях.

2